中國中醫科學院（原名中國中醫研究院）成立于1955年，是國家中醫藥管理局直屬的集科研、醫療、教學為一體的綜合性中醫藥研究機構。現任院長張伯禮，黨委書記王煉。

　　中國中醫科學院學科齊全，設備先進，科研力量雄厚，下設17個研究所、6家醫療機構、1個研究生院、2家分院以及2家制藥企業和中醫古籍出版社、中醫雜志社等學術單位；

　　現有職工6181人，專業技術人員3587人。擁有王永炎、陳可冀、李連達、張伯禮、黃璐琦5名院士，擁有唐由之、路志正、陳可冀、劉志明4名國醫大師；擁有首席研究員26名，聘請院外客座研究員68名，擁有國家非物質文化遺產項目代表性傳承人6名。與世界衛生組織（WHO）共同建立了臨床研究信息、針灸、中藥三個傳統醫學合作中心。世界針灸學會聯合會、中國中西醫結合學會、中國針灸學會均設在中國中醫科學院。

　　中醫藥科學研究是中國中醫科學院的中心任務。建院60余年來，中國中醫科學院在中醫藥基礎理論、重大疾病中醫藥防治及中藥新藥研發等多方面取得了顯著成就。截止2016年底，全院共獲得各級科技獎勵683項，其中國家科學技術獎57項，全國十大科技成就及全國科學大會獎18項，其他政府及社會力量獎573項。被譽為中藥科學研究豐碑的青蒿素及雙氫青蒿素研究，榮獲國際發明二等獎和全國十大科技成就獎；“血瘀證與活血化瘀研究”獲得國家科技進步一等獎。屠呦呦終身研究員由于在青蒿素發現及其應用于治療瘧疾方面做出的杰出貢獻，先后于2011年獲美國拉斯克臨川醫學獎、2015年獲哈佛大學醫學院華倫.阿爾波特獎，2015年10月榮獲諾貝爾生理學獲醫學獎，成為在中國大陸開展科學研究并獲得諾貝爾科學獎的第一位中國科學家，中國科學界迄今為止獲得的世界級最高大獎，也是中國醫學界、中醫藥成果迄今為止獲得的最高獎項。繼諾獎之后，屠呦呦有榮獲得2016年國家最高獎，成為我院科技獎獎勵史上的新突破。

　　中醫科學院擁有地道藥材國家重點實驗室培育基地、中藥過程控制技術國家工程實驗室、中藥臨床療效和安全性評價國家工程實驗室、國家新藥（中藥）臨床試驗研究機構（GCP）、國家中藥安全性評價中心（GLP）和4家國家中醫臨床研究基地、14個國家中醫藥管理局重點研究室、38個國家中醫藥管理局重點學科、28家國家中醫藥管理局三級實驗室。

　　中國中醫科學院充分發揮中醫醫療特色優勢，積極為廣大患者提供良好的醫療服務，在抗擊重大床染病、抗震救災等重大公共衛生事件中發揮了積極作用。附屬西苑醫院、廣安門醫院、望京醫院、眼科醫院是三級甲等中醫醫院，另有針灸醫院、中醫門診部兩家醫療機構。2016年全院開放病床2704張，年門（急）診總量已達到938萬人次，出院人數7.47萬人次。全院在中醫藥治療腫瘤、心血管、老年病、糖尿病、骨傷科、眼科血液病、腎病、皮膚病等常見病、多發病、疑難重癥的中醫及中西醫結合治療方面，具有豐富的經驗和獨特的療效，在國內外有較高的聲譽。目前共有國家中醫臨床研究基地4個，國家衛生計生委臨床重點專科16個，國家中醫藥管理局中醫重點專科43個，北京是中醫重點專科11個。2011年廣安門醫院正式托管大興區中醫醫院，為深化醫改“托管模式”發揮了良好的示范作用。

　　中國中醫科學院是培養中醫藥高層次人才的重要基地，為中醫藥行業培養了大批優秀中醫藥人才。現有中醫學、中藥學、中西醫結合三個一級學科所涵蓋的所有學科專業的博士、碩士學位授予權及圖書與情報管理一級學科的碩士學位授予權。有中醫學、中藥學、中西醫結合三個一級學科的博士后科研流動站，2016年底在站博士后研究人員341人。

　　中國中醫科學院圖書館是全國藏書最多的中醫藥專業圖書館，藏書36萬余冊，其中珍本、善本、孤本書籍2萬余冊，是國家古籍重點保護單位、國家級古籍修復中心及全國中醫行業古籍保護中心。中國醫史博物館是我國收藏文物最多的中醫專業博物館，收藏文物3000余件。中國中醫科學院主辦和承辦18種全國性中醫藥專業期刊，其中《中國結合醫學雜志》、《中醫雜志》英文版為SCI-E收錄期刊。

　　作為我國傳統醫藥對外合作與交流的重要窗口，中國中醫科學院已與世界上100多個國家和地區的醫藥界、科研院所、高等院校、企業及民間團體開展了廣泛的聯系與交流，與60多個國家和地區簽訂了80多項合作協議，在國際傳統醫學界有重大的學術影響。